Geirfa

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, fel arfer yn cyfuno â 2,4-dinitrophenyl (Dnp) neu 3-nitro-tyrosine (NitroTyr) i ffurfio parau Fluorophore/Quencher. cyffro ar 320 nm, allyriadau ar 420 nm.

3-Gellir gweld Abz (asid m-aminobenzoic) fel asid -amino. Pan fydd asid m-aminobenzoic yn cael ei ymgorffori mewn cadwyni peptid, mae'n arwain at dro anhyblyg.

4-Gall Abz (asid p-Aminobenzoic, PABA), sy'n ddeilliad asid benzoig sy'n digwydd yn naturiol, hefyd gael ei ddefnyddio fel peiriant gwahanu llinellol anhyblyg.

Mae Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), -aminobutyric acid, yn ddeilliad asid amino. Oherwydd ei debygrwydd strwythurol i asidau amino naturiol, fe'i defnyddir yn aml wrth ddylunio a synthesis peptidau a mimetigau peptid.

Mae Ac yn cynrychioli asetyl. Mae asetyleiddiad N-terminal yn addasiad sefydlogi cyffredin ar gyfer peptidau mewn natur.

Gellir tynnu Acm, Acetamidomethyl, gan ddefnyddio Hg(II) neu Ag(I). Mae'n un o'r grwpiau diogelu thiol a ddefnyddir yn gyffredin ar gyfer cystein wrth syntheseiddio peptidau â bondiau disulfide lluosog.

Mae ACTH (hormon adrenocorticotropic) yn hormon sy'n cael ei ryddhau gan y pituitary blaenorol sy'n ysgogi'r cortecs adrenal i gynhyrchu corticosteroidau.

Mae Aad (L- -asid aminoadipic) yn asid amino nad yw'n broteinogenig. Mae ei strwythur yn debyg i asid glutamig (Glu), gyda grŵp methylene ychwanegol yn ei gadwyn ochr.

(2-Aminoethoxy) asid asetig, a elwir hefyd yn glycine ethyl ester neu glycine ethylamide, gellir ei ddefnyddio fel spacer neu linker mewn synthesis addasu peptid.

Gall 1-(1'-adamantyl)-1-methyl-ethoxycarbonyl, grŵp diogelu amino asid-labile iawn mewn synthesis peptidau, gael ei ddadamddiffyn gan 3% TFA/CH2Cl2

Mae AFC (7-Amino-4-trifluoromethylcoumarin) yn gyfansoddyn fflwroleuol gyda chyffro o'r coumarin a ryddhawyd yn 395-400 nm, allyriad ar 495-505 nm.

Mae rhywogaethau pwysau moleciwlaidd uwch yn cael eu ffurfio oherwydd adlyniad an-cofalent rhywogaethau llai. Mewn proteinau yn benodol, mae agregu yn fath o ddadnatureiddio a all ddigwydd ar arwynebau anpolar â strwythurau eilaidd, fel y rhai sydd fel arfer yn ffurfio rhyngweithiadau mewnfoleciwlaidd ac sy'n cael eu claddu yn -helices a -sheets y protein. Mae moleciwlau'n rhyngweithio â'i gilydd, weithiau'n ffurfio ffurfiau polymoleciwlaidd anhydawdd. Mae agregu yn cyferbynnu ag oligomerization, y rhyngweithio arferol o broteinau brodorol wedi'u plygu'n gywir i ffurfio polymerau lefel uwch.

AHX, Aminohexanoyl,6-asid amino hecsanoig, hefyd wedi'i dalfyrru Aca neu LC, Wedi'i gyflwyno'n nodweddiadol fel gwahanydd amhenodol byr rhwng dilyniannau biotin, fflworoffores a pheptid.

2-Mae asid aminoisobutyrig yn asid amino di-brotein prin sy'n gynnyrch terfynol metaboledd pyrimidin ac sy'n cael ei ysgarthu yn yr wrin ac sy'n bresennol mewn rhai gwrthfiotigau o darddiad ffwngaidd. Defnyddir hefyd i ddisodli asidau amino naturiol ar gyfer synthesis peptidau.

Alcoholau yw'r cyfansoddion organig hynny sy'n cael eu nodweddu gan bresenoldeb un, dau neu fwy o grwpiau hydrocsyl (−OH) sydd ynghlwm wrth yr atom carbon mewn grŵp alcyl neu gadwyn hydrocarbon. Mae alcoholau peptid yn gyfansoddion clinigol hanfodol nad ydynt yn cael eu hymchwilio'n ddigonol yn yr astudiaethau perthynas strwythur-gweithgaredd (SAR) ar gyfer darganfod cyffuriau. Er enghraifft, mae DAMGO yn weithydd derbynnydd opioid wedi'i addasu gan alcohol yn y C-terminal, gyda dilyniant Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Mae ganddo ddetholusrwydd ac affinedd uchel ar gyfer y derbynnydd μ-opioid.

Mae aldehyd yn gyfansoddyn organig lle mae'r grŵp carbonyl ynghlwm wrth atom carbon ar ddiwedd cadwyn garbon. Mae aldehydau peptid yn arfau pwysig mewn biocemeg a bioleg gemegol ar gyfer atal ac analluogi cemegol proteasau.

Aloc - Allyloxycarbonyl, grŵp amddiffyn amino (talfyriad hefyd Alloc). Gellir dileu amddiffyniad gyda Pd(PPh3)4.

Mae clefyd Alzheimer, sydd wedi'i nodi gan -amyloid placiau a tau tangles, yn deillio o gamweithrediad synaptig a phroblemau llwybr clirio, gan achosi nam gwybyddol.

Mae 7-Amino-4-methylcoumarin (AMC) yn archwiliwr fflwroleuol cyffredin ar gyfer labelu peptidau mewn astudiaethau proteas. Mae ei gydgysylltiad â pheptid yn diffodd y signal fflwroleuol, a gall yr AMC a ryddhawyd ar holltiad proteas fesur gweithgaredd ensymau, gydag uchafswm cyffro / allyriad o 345/445 nm. Er enghraifft, y peptid fflwroleuol swbstrad a ffefrir ar gyfer pennu gweithgaredd tebyg i drypsin o proteasome wedi'i buro, gyda'r dilyniant: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Peptid natriwretig atrïaidd (ANP), hormon sy'n cael ei gynhyrchu a'i ryddhau gan atria'r galon mewn ymateb i gynnydd mewn cyfaint gwaed a phwysedd gwaed. Mae'n gweithredu i reoleiddio cydbwysedd hylif a phwysedd gwaed trwy hyrwyddo vasodilation, cynyddu cynhyrchiad wrin (diuresis), a lleihau adamsugniad sodiwm yn yr arennau. Mae'r gweithredoedd hyn yn helpu i wrthweithio effeithiau pwysedd gwaed uchel a gorlwytho hylif yn y corff.

Mae peptidau antigenig yn ddilyniannau asid amino byr sy'n deillio o broteinau neu fiomoleciwlau eraill sy'n sbarduno ymateb imiwn organeb. Mae'r peptidau hyn yn cael eu cydnabod gan y system imiwnedd fel rhai tramor neu dramor i'r corff, gan arwain at actifadu celloedd imiwnedd fel celloedd T a chelloedd B. Mae peptidau antigenig yn chwarae rhan hanfodol mewn ymatebion imiwn, gan gynnwys cynhyrchu gwrthgyrff addasol a datblygu cof imiwn. Cânt eu hastudio'n eang mewn imiwnoleg a datblygu brechlyn oherwydd eu potensial i ysgogi ymatebion imiwn penodol yn erbyn pathogenau neu gelloedd annormal.

Gellir cyflawni synthesis peptidau anghymesur â 2, 4, ac 8 cangen trwy fewnosod lysin, arginin, neu asid glutamig yn y dilyniant peptid yn strategol.

Mae dimethylarginine anghymesur (ADMA, Arg(Me)2) yn gyfansoddyn cemegol sy'n digwydd yn naturiol ac yn atalydd mewndarddol o nitric ocsid synthase (NOS). Gellir defnyddio Fmoc-Arg(Me)2-OH (anghymesur) yn uniongyrchol ar gyfer syntheseiddio peptidau sy'n cynnwys dimethylarginine anghymesur.

5-Asid aminovaleric, gellir ei ddefnyddio fel spacer neu gysylltydd mewn synthesis addasu peptid.

Mae Benzyloxymethyl (Bom) yn grŵp amddiffyn imidazole asid-labile a ddefnyddir yn y broses Boc-SPPS ar gyfer peptidau sy'n cynnwys histidine. Mae benzyloxymethyl yn cynhyrchu fformaldehyd adweithiol iawn ar ôl triniaeth ag asid. Felly, Bom yw'r gorau sydd wedi'i hollti ym mhresenoldeb Cys, methoxyamine neu gyfansoddion eraill sy'n adweithio ag aldehydau.

Mae gan asidau -amino eu grŵp amino ynghlwm wrth y -carbon, sef yr ail atom carbon i ffwrdd o'r grŵp carbocsyl. Gellir cynrychioli'r fformiwla adeileddol gyffredinol ar gyfer asid -amino fel: R−CH(NH2) -COOH

Peptid natriwretig math B (BNP), hormon a gynhyrchir yn bennaf gan fentriglau'r galon mewn ymateb i ymestyn gormodol ar gelloedd cyhyr y galon. Mae'n chwarae rhan hanfodol wrth reoleiddio pwysedd gwaed a chydbwysedd hylif, yn bennaf trwy hyrwyddo vasodilation a chynyddu ysgarthiad sodiwm trwy'r arennau.

Mae t-Butyloxycarbonyl (Boc) yn grŵp amddiffyn asid-labilea -amino iawn mewn synthesis peptid, y gellir ei hollti gan TFA / methylene clorid (1: 1), HCl mewn asetad ethyl neu ddeuocsane, 98% asid fformig.

Mae 2-(4-Deuffenyyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) yn grŵp amddiffyn asid-labilea-amino iawn mewn synthesis peptidau, gellir ei hollti gan ag 1% TFA/methylene clorid.

Gellir cyflawni peptidau â 2, 4, ac 8 cangen trwy fewnosod lysin, arginin, neu asid glutamig yn y dilyniant peptid yn strategol.

Mae t-Butyldimethylsilyl (TBS neu TBDMS) yn grŵp amddiffyn hydrocsyl sy'n gydnaws â Fmoc-SPPS. Mae'n asid-labile a gellir ei hollti'n ddetholus gan ïonau fflworid.

Mae Benzoyl yn grŵp acyl a gyflwynir yn aml ar derfyn N peptidau. Mae'n llai pegynol nag asetyl (Ac) a gall fod fel addasiad parhaol.

Benzyl (Bzl) sef gweddillion alcyl a grŵp amddiffyn cadwyn ochr a ddefnyddir ar gyfer blocio alcoholau (Ser, Thr, Hyp) mewn synthesis peptid. gellir ei hollti gan asidau cryf neu hydrogenolysis catalytig (ee hydrogen/Pd).

Mae colecystokinin (CCK) yn hormon peptid a gynhyrchir gan fwcosa rhan uchaf y coluddyn ac a geir yn y system nerfol ganolog. Mae'n ysgogi cyfangiad goden fustl, rhyddhau ensymau pancreatig, ac yn dylanwadu ar brosesau gastroberfeddol amrywiol.

Mae peptid sy'n gysylltiedig â genynnau calcitonin (CGRP) yn 37-peptid asid amino sy'n gysylltiedig â calcitonin, amylin, ac adrenomedullin. Mae'n bodoli mewn dwy ffurf, -CGRP (CGRP I) a -CGRP (CGRP II), gyda gweithgareddau biolegol tebyg. Mae CGRP i'w gael yn bennaf mewn niwronau synhwyraidd a chanolog, gan ddylanwadu ar swyddogaeth gardiofasgwlaidd, metaboledd calsiwm, a thôn fasgwlaidd ffetoplacental. Mae ei dderbynyddion wedi'u cyplysu â phrotein G ac yn actifadu cyclase adenylate, gan ryngweithio â gweithgaredd derbynyddion sy'n addasu proteinau (RAMPs) ar gyfer penodoldeb ligand a masnachu cellog.

Mae L-Cyclohexylalanine (Cha) yn analog asid amino an-begynol o phenylalanine, lle mae'r cylch aromatig yn cael ei ddisodli gan gylch cyclohexane. Mae'r amnewidiad hwn yn caniatáu astudio rôl asidau amino aromatig mewn rhyngweithiadau megis rhyngweithiadau π-π trwy ddisodli gweddillion ffenylalanin â Cha mewn arbrofion.

L- -Mae seiclohexylglycine (Chg) yn asid amino an-begynol sy'n cael ei rwystro'n sterigol. Mae'n gweithredu fel canolradd fferyllol sylweddol ac fe'i darganfyddir hefyd mewn cynhyrchion naturiol.

Mae colesterol yn cael ei gynhyrchu'n naturiol gan yr afu a chelloedd eraill yn y corff, ond gall hefyd ddod o'r bwyd rydyn ni'n ei fwyta, yn enwedig o gynhyrchion anifeiliaid fel cig, dofednod, a chynhyrchion llaeth braster llawn. Gellir cysylltu colesterol â pheptidau i wella ffarmacocineteg.

cis-Hydroxyproline, stereoisomer traws-hydroxyproline naturiol.

Mae citrulline yn bresennol mewn proteinau o ganlyniad i addasiad ensymatig ôl-gyfieithu o weddillion arginin.

Mae CMK yn atalydd kinase RSK2 gyda nerth tebyg ond llai o sefydlogrwydd cemegol na FMK.

Mae peptid natriwretig math-C (CNP) yn peptid gan gelloedd endothelaidd fasgwlaidd, sy'n adnabyddus am ei effeithiau vasodilatory. Mae'n dangos tebygrwydd strwythurol a ffisiolegol i peptidau natriwretig atrïaidd ac ymennydd (ANP a BNP).

L- -Mae cyclopentylglycyl (Cpg), yn asid amino an-begynol sy'n cael ei rwystro'n sterigol.

Mewn dilyniant peptid, y gweddillion unigryw hwnnw sydd wedi'i gysylltu â'r dilyniant llinol gan ei grŵp amino, gan ei adael gyda grŵp carboxyl am ddim. Gall y grŵp carboxyl gweddillion hwn gael ei addasu fel amidation neu, mewn achosion fel pyroglutamad, lactamization mewnol.

Lliw cyanin fflwroleuol coch yw Cyanine 3 sy'n cael ei gyffroi'n gyffredin gan ffynhonnell golau o gwmpas 558 nm ac sy'n allyrru golau tua 572 nm.

Mae Cyanine 5 yn fflworoffor llifyn cyanin sy'n allyrru fflworoleuedd bron isgoch sy'n cael ei gyffroi'n gyffredin gan ffynhonnell golau o gwmpas 646 nm ac sy'n allyrru golau tua 664 nm.

Mae asid L- , -Diaminobutyric yn asid ω-diamino, analog byrrach o ornithin (Orn) a lysin (Lys). Gyda diogelwch priodol, gellir addasu asidau ω-diamino yn ddetholus yn eu safle Nω neu eu hymgorffori i greu peptidau canghennog neu dendrimers.

Mae 3-(Dimethylaminoazo)bensen-4-asid carbocsilig, yn gromoffor sy'n gysylltiedig â grwpiau amino a ddefnyddir mewn cymwysiadau biocemeg a bioleg foleciwlaidd fel quencher mewn trosglwyddo egni cyseiniant fflworoleuedd (FRET), ee gyda EDANS. Cyffro DABCYL yn 454 nm.

Dabsyl ,4-dimethylaminobenzenesulfonyl clorid, Cromoffor sy'n gysylltiedig â grwpiau amino a ddefnyddir fel quencher mewn cyfuniad, ee ag EDANS. Cyffro Dabsyl yn 436 nm.

4-Dimethylamino-1-naphthalene-sulfonyl, fflworophor sy'n gysylltiedig â grwpiau amino, cyffro ar 342 nm, allyriadau ar 562 nm.

Mae asid L-, -Diaminopropionig (Dap neu Dpr) yn asid ,ω-diamino, sy'n analog byrrach o asid diaminobutyrig (Dab), ornithine (Orn), a lysin (Lys). Gellir newid deilliadau wedi'u haddasu o asidau ω-diamino yn ddetholus yn eu safle Nω neu eu hymgorffori i greu peptidau canghennog neu dendrimers.

Mae 1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) yn grŵp amddiffyn amino a ddefnyddir mewn synthesis peptidau. Gellir ei hollti'n ddetholus gan ddefnyddio hydrad hydrazine 2% mewn dimethylformamide (DMF). Mae Nω-Dde yn caniatáu ar gyfer tynnu Dde yn benodol o asidau amino megis Dap, Dab, Orn, neu Lys ar ôl synthesis peptid cyfnod solet Fmoc (SPPS), gan hwyluso addasiad ar-resin o'r grŵp Nω-amino.

Mae bondiau disulfide yn fondiau cofalent sy'n cael eu ffurfio rhwng dau grŵp sulfhydryl (-SH) o weddillion cystein mewn proteinau.

Mae 2,4-dimethoxybenzyl yn grŵp amddiffyn formamid asid-labile a ddefnyddir ar gyfer addasu asgwrn cefn cildroadwy mewn synthesis peptidau. Maent yn cael eu hymgorffori yn ystod synthesis peptid cyfnod solet (SPPS) fel yr asid amino neu dipeptide Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), lle mae Fmoc yn atal agregu peptidau ac felly'n hyrwyddo elongation effeithlon. Mae Dmb hefyd yn hyrwyddo adweithiau cyclization ac yn atal ffurfio asparagimide. Yn wahanol i ddeilliadau Hmb, nid yw Dmb yn ffurfio benzoxazepines yn ystod actifadu.

2,4-Mae dinitrophenyl yn gromoffor sy'n cael ei gyfuno â grwpiau amino, a ddefnyddir yn gyffredin fel quencher mewn swbstradau trosglwyddo egni cyseiniant fflworoleuedd (FRET).

Mae 4,4′-Dimethoxydityl, a elwir hefyd yn bis-(4-methoxyphenyl)methyl, yn grŵp amddiffyn carbocsamid asid-labile sy'n gydnaws â synthesis peptid cyfnod solet Fmoc (SPPS).

Mae DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, yn rhagflaenydd i sawl niwrodrosglwyddydd hanfodol, gan gynnwys dopamin, norepinephrine, ac epineffrîn.

(4,7, 10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-asid asetig, wedi'i dalfyrru fel DOTA, yn chelator cylchol sydd fel arfer yn gysylltiedig â therminws N peptidau. Mae DOTA yn hwyluso labelu peptidau â radioniwclidau fel 68Ga neu 90Y ar gyfer cymwysiadau biofeddygol amrywiol, gan gynnwys delweddu a therapi wedi'i dargedu.

Diphenylmethyl (dityl), grŵp amddiffyn asid-labile N-, O-, ac S.

Mae asid diethylenetriaminepentasetig (DTPA) yn gyfrwng chelating defnyddiol ar gyfer radioniwclidau fel (68) Ga, (99m) Tc a (111)In, sy'n berthnasol i ddelweddu meddygaeth niwclear.

Mae 5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-asid sulfonic (EDANS) yn fflworoffor sy'n cael ei gysylltu'n gyffredin â'r Nω o asidau diamino fel lysin. Fe'i defnyddir yn aml mewn swbstradau FRET, fel arfer wedi'u paru â quenchers fel DABCYL. Mae gan EDANS donfedd cyffro o 340 nm ac mae'n allyrru ar 490 nm.

polypeptid sy'n ysgogi monocyte endothelaidd.

Defnyddir Ethyl, grŵp alcyl a homolog o methyl (Me), ar gyfer addasiadau N- a S-ethylation parhaol mewn peptidau.

Mae mapio epitope (mapio antigen epitope) yn dechneg a ddefnyddir i bennu'r ardaloedd penodol (hynny yw, epitopau antigen) ar antigen y gellir ei adnabod gan wrthgyrff neu'r system imiwnedd. Gellir rhannu epitopau antigen yn epitopau llinol ac epitopau cydffurfiad. Trwy fapio antigen epitope, gallwn ddeall yn ddwfn y berthynas rhwng strwythur a swyddogaeth yr antigen, sydd o arwyddocâd mawr wrth ddatblygu brechlynnau, diagnosis clefydau, imiwnotherapi ac agweddau eraill.
Mae rhai dulliau mapio antigen epitope a ddefnyddir yn gyffredin yn cynnwys:
Crisialograffi pelydr-X: Gall ddadansoddi strwythur tri dimensiwn yr antigen yn uniongyrchol, a thrwy hynny bennu lleoliad yr epitope.
Cyseiniant magnetig niwclear: Gellir ei ddefnyddio hefyd i ddadansoddi strwythur yr antigen i bennu'r epitope.
Techneg sganio peptid: Defnyddio cyfres o segmentau peptid synthetig sy'n gorgyffwrdd i adnabod yr epitope sy'n clymu i'r gwrthgorff.
Er enghraifft, mewn ymchwil a datblygu brechlyn, mae egluro'r epitopau allweddol ar yr antigen yn helpu i ddylunio brechlynnau mwy effeithiol ac yn ysgogi ymateb imiwn wedi'i dargedu'n fwy; wrth wneud diagnosis o glefydau, gall pennu epitopau antigen sy'n gysylltiedig â chlefydau penodol ddatblygu adweithyddion diagnostig mwy cywir.

Mae 5-FAM (5-Carboxyfluorescein) yn fflworoffor a ddefnyddir yn gyffredin ar gyfer labelu biomoleciwlau, gyda thonfedd cyffro o 490 nm ac allyriad ar 520 nm.

Mae fflworoleuedd-6-carbonyl yn fflworoffor sydd wedi'i gysylltu â grwpiau amino, gyda thonfedd cyffro o 490 nm ac allyriadau ar 520 nm.

Mae fluorescein isothiocyanate (FITC) yn fflworoffor sy'n adweithio â grwpiau amino. Wrth dagio peptid yn ei derfynfa N gyda FITC, mae gofodwr fel -alanine neu Ahx yn cael ei fewnosod yn gyffredin. Mae gan FITC donfedd cyffro o 490 nm ac allyriadau ar 520 nm.

9-Mae fluorenylmethyl yn grŵp amddiffyn label-sylfaen a ddefnyddir ar gyfer amddiffyn O- ac S.

Mae FMK, fluoromethyl ketone, yn atalydd anwrthdroadwy o RSK2 kinase.

9-Gellir cael gwared ar fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), y grŵp amddiffyn amino mewn synthesis cyfnod solet FMOC, gyda 20% piperidine/DMF.

Mae Formyl yn grŵp amddiffyn indole a ddefnyddir yn Boc-SPPS. Mae Trp(For) yn cael ei hollti gan HF ym mhresenoldeb mercaptan neu gan fasau fel piperidine.

Trosglwyddo egni cyseiniant fflworoleuedd (FRET) yw trosglwyddo egni anymbelydrol o fflworoffor cynhyrfus (rhoddwr) i dderbynnydd addas (quencher). Mae'r trosglwyddiad yn dibynnu ar bellter, cyfeiriadedd deupol, a gorgyffwrdd sbectrol y rhoddwr a'r derbynnydd. Mewn swbstradau FRET, mae'r fflworoffor a'r quencher wedi'u cysylltu trwy gadwyn peptid. Mae holltiad ensymatig yn cynyddu fflworoleuedd trwy wahanu rhoddwr a derbynnydd.

Fflworoleuedd yw'r golau a allyrrir gan sylwedd sy'n amsugno golau neu ymbelydredd electromagnetig arall. Mae hyn yn digwydd pan fydd moleciwlau o'r enw fflworofforau yn amsugno ffotonau o donfedd benodol, yn cynhyrfu, ac yna'n allyrru ffotonau ac yn dychwelyd i'w cyflwr daear. Yn nodweddiadol mae gan y golau a allyrrir donfedd hirach ac egni is na'r golau a amsugnir, gan arwain at sbectrwm fflworoleuedd nodweddiadol. Defnyddir y ffenomen hon yn eang at amrywiaeth o ddibenion gwyddonol a meddygol, gan gynnwys microsgopeg, cytometreg llif, a sbectrosgopeg fflworoleuedd.

Mae polypeptid ataliol gastrig (GIP), a elwir hefyd yn peptid inswlinotropig sy'n ddibynnol ar glwcos, yn perthyn i'r teulu secretin o hormonau. Mae'n ysgogi secretiad inswlin, yn atal secretiad asid gastrig, ac yn chwarae rhan hanfodol wrth reoleiddio secretiad inswlin a homeostasis glwcos.

L- -Mae asid carbocsyglutamig (Gla) yn cael ei ffurfio trwy garbocsiliad ôl-gyfieithiad o asid glutamig, gan arwain at broteinau sy'n gallu rhwymo ïonau calsiwm, fel osteocalcin. Yn ddelfrydol, mae peptidau sy'n cynnwys gla yn cael eu syntheseiddio gan ddefnyddio synthesis peptid cyfnod solet Fmoc (SPPS), oherwydd gall Gla gael ei ddatgarbocsio i gynhyrchu asid glutamig ym mhresenoldeb asidau cryf.

Mae peptidau tebyg i glwcagon yn aelodau o'r superfamily glwcagon o hormonau peptid sy'n deillio o ranbarth C-terminal y proglucagon. Maent yn cael eu syntheseiddio'n bennaf gan gelloedd L berfeddol.

Mae hormon sy'n rhyddhau gonadotropin (LHRH) yn hormon decapeptid a gynhyrchir mewn celloedd niwrosecretory hypothalamig a'i ryddhau mewn pyliau curiad y galon i gylchrediad y porth pituitary. Mae secretiad curiadol yn hanfodol ar gyfer swyddogaethau atgenhedlu, datblygiad rhywiol a gwahaniaethu.

Mae hormon sy'n rhyddhau hormonau twf (GHRH), a elwir hefyd yn somatorelin, yn hormon peptid hypothalamig sy'n ysgogi'r chwarren bitwidol i ryddhau a syntheseiddio hormon twf.

Mae hormon sy'n rhyddhau hormonau twf (GHRH), a elwir hefyd yn somatorelin, yn hormon peptid hypothalamig sy'n ysgogi'r chwarren bitwidol i ryddhau a syntheseiddio hormon twf.

Mae antigen leukocyte dynol (HLA) yn cyfeirio at grŵp o broteinau a geir ar wyneb celloedd sy'n chwarae rhan hanfodol yn adnabyddiaeth y system imiwnedd o sylweddau tramor. Cânt eu hamgodio gan y genynnau prif gymhleth histocompatibility (MHC) mewn bodau dynol ac maent yn hanfodol ar gyfer cyflwyno antigenau i gelloedd T, gan alluogi'r system imiwnedd i wahaniaethu rhwng celloedd hunan a chelloedd nad ydynt yn hunan. Mae moleciwlau HLA yn amrywiol iawn ac yn amrymorffig, gan gyfrannu'n sylweddol at ymatebion imiwn unigol a thueddiad i glefydau hunanimiwn a gwrthodiad trawsblaniad.

Mae 2-hydroxy-4-methoxybenzyl yn grŵp amddiffyn formamid asid-labile a ddefnyddir ar gyfer addasu asgwrn cefn cildroadwy mewn synthesis peptidau. Mae wedi'i ymgorffori fel asid amino neu Fmoc-Hmb dipeptide (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) yn ystod synthesis peptid Fmoc cyfnod solet (SPPS), gan atal agregu a galluogi estyniad peptid effeithlon. Mae Hmb hefyd yn cynorthwyo mewn adweithiau cylchredeg ac yn atal asparagin rhag ffurfio.

Mae L-Homoarginine yn homolog o L-arginine, wedi'i dalfyrru fel Har, ac i'w gael mewn plasma ac wrin. Mae Homoarginine yn ganlyniad i guanidination lysin, y gellir ei berfformio hefyd ar peptidau a phroteinau.

Mae Homocitrulline yn homolog o L-citrulline, wedi'i dalfyrru fel Hci, a gellir ei ganfod mewn wrin dynol.

Mae L-homocysteine ​​yn homolog o cystein, wedi'i dalfyrru fel Hcy, ac fe'i cynhyrchir trwy ddadmethylation methionine. Mae lefelau Hcy gwaed uchel yn ffactor risg ar gyfer clefydau cardiofasgwlaidd a niwroddirywiol. Mewn cyferbyniad â deilliadau Cys, nid yw deilliadau Hcy yn racemize yn ystod cyplu, nac yn -elimin.

Homologues of L-leucine, a dalfyrrir fel Hle.

Mae homophenylalanine, homolog o ffenylalanin, wedi'i dalfyrru fel Hph, yn rhan o atalyddion ACE a renin. Mae Fmoc-Homophe-OH yn gyffur gwrthlidiol posibl.

L-homoproline neu asid L-picolic, wedi'i dalfyrru fel Pip neu Hpr. Mae'r homolog proline Hpr yn gynnyrch diraddio L-lysin. Gellir canfod y ddau enantiomer mewn plasma dynol. Gan fod gweddillion proline yn dylanwadu'n gryf ar gydffurfiad y peptid, gall disodli Pro â Hpr (neu azetidine-2-asid carbocsilig (Aze)) fodiwleiddio ei strwythur eilaidd.

Cynhyrchir L-transhydroxyproline yn ôl-gyfieithu trwy ocsidiad proline. Mae Hyp yn elfen bwysig o brotein colagen a chregyn gleision.

Mae isoserine, isomer o L-serine, yn asid -amino.

Gall ivDde, grŵp amddiffyn amino, gael ei ddad-ddiogelu a'i hollti gan hydrad hydrazine 2% yn DMF. ivDde yn fwy sefydlog na ‘I aml driniaethau piperidine lluosog yn ystod Fmoc-SPPS. Gellir tynnu Nω-ivDde yn ddetholus o Dap, Dab Orn, neu Lys, gan ganiatáu addasiad ôl-synthetig ar-resin o'r grŵp Nω-amino.

Mae hemocyanin llygad coch twll clo (KLH) yn feteloprotein aml-subunit mawr sy'n cario ocsigen ac sydd i'w gael yn hemolymff hemocyanin llygad y clo anferth. Fel cludwr antigen, mae KLH fel arfer yn gwella galluoedd imiwnogenigrwydd a gosod antigen trwy gyplu dilyniannau polypeptid targed, gan hyrwyddo'n sylweddol y broses o gynhyrchu gwrthgyrff effeithlon, penodol a swyddogaethol.

Mae hormon sy'n rhyddhau hormonau luteinizing (LHRH neu GnRH) yn hormon decapeptid sy'n cael ei syntheseiddio gan gelloedd niwrosecretory o fewn yr hypothalamws a'i ryddhau'n pulsatilely i gylchrediad y porth pituitary. Mae secretiad curiadol yn hanfodol ar gyfer swyddogaeth atgenhedlu, datblygiad rhywiol a gwahaniaethu.

Mewn dylunio a synthesis peptidau, gall ymchwilwyr fewnosod cysylltydd rhwng y biotin neu'r fflwroleuol a'r peptidau. Gwahanydd hydroffobig cyffredin yw asid aminohecsanoig (Ahx), a gwahanydd hydroffilig cyffredin yw poly(ethylen) glycol (PEG).

Proses rewi-sychu, sy'n tynnu hylif o ddeunyddiau sy'n sensitif i wres. Mae'r deunydd wedi'i rewi, ei roi o dan wactod uchel, a'i gadw ar dymheredd isel. Mae'r pwysau a grëir gan y gwactod yn achosi i'r iâ newid o gyflwr solet i gyflwr nwyol heb basio trwy'r cyflwr hylif. Mae peptidau fel arfer yn cael eu danfon fel powdr lyophilized.

Mae cromatograffaeth hylif - sbectrometreg màs yn dechneg ddadansoddol amlbwrpas sy'n integreiddio cromatograffaeth hylif â sbectrometreg màs i ddarparu gwybodaeth fanwl am gyfansoddiad a strwythur moleciwlau o fewn samplau cymhleth.

Peptidau Antigenig Lluosog. Mae Peptid Antigenig Lluosog yn un ffordd rymus o gynhyrchu gwrthgyrff gwrth-peptid lefel uchel a brechlynnau peptid synthetig.

Techneg ddadansoddol a ddefnyddir i fesur cymhareb màs-i-wefr ïonau yw Sbectrometreg Màs â Chymorth Matrics ar gyfer Assugno/Ioneiddiad Laser â Chymorth Matrics (MALDI-MS). Mae'n arbennig o ddefnyddiol ar gyfer dadansoddi biomoleciwlau fel peptidau, proteinau a pholymerau.

Mae sbectrometreg màs (MS) yn dechneg ddadansoddol bwerus a ddefnyddir i fesur cymhareb màs-i-wefr (m/z) ïonau.

Mae 4-Methoxy- -naphthylamide, a dalfyrrir fel MNA, yn fflworoffor sydd fel arfer yn cael ei gysylltu â swbstrad carboxypeptidas ar derfynell C. Wedi hollti 4M NA yn cyffroi ar 335-350 nm ac yn allyrru ar 410-440 nm

Mae Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) yn grŵp amddiffyn guanidyl a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS). Gall y grŵp amddiffyn hwn gael ei ddadamddiffyn trwy holltiad â hydrogen fflworid (HF).

4-Mae Methylbenzyl (Mbzl) yn grŵp amddiffyn sylffhydryl a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS). Mae Mbzl yn fwy sefydlog na methoxybenzyl (Mob) o dan driniaethau aml asid trifluoroacetig (TFA) a gellir ei ddileu trwy holltiad hydrogen fflworid (HF).

Mae (7-methoxycoumarin-4-yl)asid asetig (Mca) yn fflworoffor y gellir ei gysylltu â grŵp amino.
Mae Mca yn rhwymo i dinitrophenyl (Dnp) ar gyfer swbstradau trosglwyddo egni cyseiniant fflworoleuedd (FRET). Y donfedd excitation yw 325 nm, a'r donfedd allyriadau yw 392 nm.

Mae hormon sy'n canolbwyntio ar felanin (MCH) yn niwropeptid cylchol sydd wedi'i ynysu gyntaf oddi wrth bysgod a llygod mawr. Mae MCH yn ymwneud yn bennaf â rheoleiddio pigmentiad croen mewn pysgod teleost ac ymddygiad bwydo mewn mamaliaid.

Mae Methyl, yr amnewidyn alcyl symlaf, yn ymwneud â N-, O-, a S-methylation, sy'n gyfystyr ag addasiadau parhaol i'r peptid.

3-Mae Methoxysuccinyl, sy'n cyfateb i Asp(OMe) wedi'i ddadamineiddio, yn grŵp blocio terfynell N pegynol sydd wedi'i ymgorffori'n gyffredin mewn swbstradau carboxypeptidas.

Mae methylation yn addasiad ôl-drosiadol (PTM) o peptidau a phroteinau lle mae grŵp methyl (-CH3) yn cael ei ychwanegu'n enzymatically at weddillion asid amino penodol, fel arfer lysin (Lys), arginine (Arg), histidine (His), neu glwtamad ( Glu). Gall yr addasiad hwn ddylanwadu'n sylweddol ar swyddogaeth protein, sefydlogrwydd, a rhyngweithiadau â moleciwlau eraill, a thrwy hynny chwarae rhan ganolog wrth reoleiddio prosesau cellog amrywiol gan gynnwys mynegiant genynnau, trawsgludiad signal, a rhyngweithiadau protein-protein.

Mae'r prif gymhleth histocompatibility (MHC) yn rhanbarth genetig sy'n cynnwys genynnau sy'n amgodio moleciwlau MHC. Mae'r moleciwlau hyn yn chwarae rhan hanfodol yn y system imiwnedd ac mewn hunanimiwnedd. Mewn bodau dynol, gelwir y cymhleth hwn hefyd yn system antigen leukocyte dynol (HLA).

Mae moleciwlau MHC dosbarth I (MHC I) yn broteinau ar arwynebau celloedd sy'n cyflwyno peptidau o'r tu mewn i'r gell i gelloedd T sytotocsig. Mae hyn yn helpu celloedd imiwnedd i adnabod a dinistrio celloedd heintiedig neu annormal, sy'n hanfodol ar gyfer amddiffyn imiwnedd rhag pathogenau a chanser.

Mae moleciwlau MHC dosbarth II (MHC II) yn broteinau arwyneb celloedd sy'n cyflwyno peptidau sy'n deillio o sylweddau tramor i gelloedd T cynorthwyol. Mae'r rhyngweithio hwn yn hanfodol ar gyfer cydlynu ymatebion imiwn ac actifadu celloedd imiwnedd eraill yn erbyn pathogenau.

Addasiad ôl-gyfieithu yw arginin monomethylated (MMA) lle mae un grŵp methyl (-CH3) yn cael ei ychwanegu'n ensymatig at nitrogen guanidino gweddillion arginin o fewn peptid neu brotein

3-mercaptopropylamine, gellir ei ddefnyddio fel ligand peptid neu addasydd mewn amrywiol gymwysiadau biocemegol a biofeddygol.

Mae myristoylation yn broses addasu lipid lle mae grŵp myristoyl, sy'n cynnwys 14-asid brasterog dirlawn carbon, wedi'i gysylltu'n cofalent â therminws N peptid. Mae'r addasiad hwn yn angori'r protein i'r gellbilen, gan hwyluso ei leoleiddio a chyfranogiad mewn prosesau cellog amrywiol.

-(1-naphthyl)-L-alanine yn deilliad asid amino amnpolar tebyg i ffenylalanine, ond gyda grŵp naphthyl yn lle grŵp ffenyl.

Mae -(2-naphthyl)alanin yn ddeilliad asid amino anpolar sy'n debyg i ffenylalanin, ond gyda grŵp naphthyl yn lle grŵp ffenyl.

Mae 3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazole (NBD) yn cael ei gyflwyno fel arfer drwy gyfuno'r adweithydd NBD-Cl â'r peptid. Mae peptidau â label NBD yn cael eu dewis yn eang oherwydd eu defnyddioldeb mewn astudiaethau sy'n canolbwyntio ar bioleg celloedd a philenni.

Gellir ystyried N-Ethylamide fel ffurf ddatgarbocsylaidd o alanin terfynell C. Yn y buserelin agonist LHRH, mae NHEt yn gwasanaethu fel analog o glycinamide C-terminal. Mae peptid N-ethylamid yn gallu gwrthsefyll diraddio gan carboxypeptidases.

Mae L-norleucine (Nle) yn isostere sefydlog o L-methionine. Pan fydd gweithgaredd biolegol peptid yn cael ei beryglu oherwydd ffurfiant sylffocsid, gellir rhoi Nle yn lle Met heb newid ei ymddygiad swyddogaethol yn nodweddiadol.

Mae NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-asid triacetig, yn chelator deuswyddogaethol sy'n gwasanaethu fel fframwaith ar gyfer adeiladu offer delweddu PET. Fe'i defnyddir hefyd wrth ddylunio chwiliwr a chwyddo signal trwy effeithiau aml-falent ac mae'n dal cymwysiadau posibl fel radiofferyllol gallium diagnostig.

Mae N-Me fel arfer yn cyfeirio at N-methylation, addasiad cemegol lle mae grŵp methyl (-CH 3 ) ynghlwm wrth atom nitrogen yn y moleciwl, fel N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me-Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, ac ati.

Mae NODAGA,1,4,7-triazaccyclononane,1-asid glwtarig-4,7-asid diasetig, yn chelator deuswyddogaethol rhagorol ar gyfer dylunio a datblygu radiofferyllol organometalig, gan gynnig gwerth sylweddol. potensial ar gyfer cymwysiadau mewn delweddu diagnostig a radiotherapi wedi'i dargedu.

2-Mae nitrophenylthio (Nps) yn grŵp amddiffyn S a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS). Gellir ei hollti gan thiols, yn benodol trwy'r grŵp sulfhydryl rhydd o cystein (Cys), gan arwain at ffurfio bond disulfide ar yr un pryd.

Mae Neuropeptid Y (NPY) yn niwropeptide amlwg yn yr ymennydd ac yn rhan o'r teulu niwropeptid Y, sy'n cynnwys polypeptid pancreatig (PP) a peptid YY (PYY).

Mae 2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) yn grŵp sy'n amddiffyn S sy'n gydnaws â synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS). Gall npys gael ei hollti gan thiols, yn benodol trwy'r grŵp sulfhydryl rhydd o cystein (Cys), gan arwain at ffurfio bond disulfide ar yr un pryd.

Mae Norvaline yn asid amino aliffatig anpolar ac yn homolog o asid -aminobutyrig (Abu).

-Mae naphthylamide yn fflworoffor a ddefnyddir yn gyffredin mewn swbstradau carboxypeptidase, sydd fel arfer yn gysylltiedig â therminws C peptidau. Mae NA wedi'i hollti yn cyffroi ar 330 nm ac yn allyrru ar 370 nm.

-Mae naphthylamide yn fflworoffor a ddefnyddir yn gyffredin mewn swbstradau carboxypeptidase, sydd fel arfer yn gysylltiedig â therminws C peptidau. NA wedi'i hollti ar 320-340 nm, allyriadau ar 410-420 nm.

Mae Allyl ester yn grŵp amddiffyn carboxyl sy'n gydnaws â synthesis peptid cyfnod solet Fmoc- a Boc (SPPS). Yn debyg i Aloc, gellir tynnu esters alyyl yn ddetholus trwy driniaeth â Pd(PPh3)4. Yn Fmoc-SPPS, mae Asp(OAall) yn agored i ffurfiant aspartimide â chatalydd sylfaen.

Gellir tynnu ester benzyl, grŵp amddiffyn carbocsyl, trwy hydrogeniad catalytig (ee H2/Pd) neu asidau cryf.

OcHex yw'r grŵp amddiffyn carboxyl safonol a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS).

Mae 4-(N-[1(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-ethylbutyl]amino)ester bensyl (ODmab) yn amddiffyn carbocsyl grŵp a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet yn seiliedig ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Gellir ei hollti a'i ddadamddiffyn gan ddefnyddio hydrad hydrazine 2% yn DMF.

2,4-Mae ester dimethoxybenzyl yn grŵp diogelu carbocsyl hynod asid-labile y gellir ei ddileu gan ddefnyddio 1% TFA mewn dichloromethan.

Ethyl ester, Oherwydd yr amodau llym sy'n ofynnol ar gyfer cael gwared ar esterau ethyl, gall addasu peptidau ag esters ethyl wella eu lipophilicity a sefydlogrwydd.

9-Mae fluorenylmethyl ester yn grŵp diogelu carbocsyl sylfaenol-labile y gellir ei ddileu gan ddefnyddio piperidine yn DMF.

Esters hecsyl, Oherwydd yr amodau llym sydd eu hangen ar gyfer cael gwared ar esterau ethyl, gall addasu peptidau ag esters ethyl wella eu lipophilicity a'u sefydlogrwydd.

Mae L-Otahydroindole-2-asid carbocsilig (Oic) yn asid amino wedi'i rwystro amnbegynol. Mae mewnosod yr asid amino hwn sy'n gysylltiedig â phroline yn y dilyniant polypeptide yn effeithio'n gryf ar gydffurfiad y peptid.

Mae esters Methyl yn grwpiau amddiffyn terfynell C lled-barhaol mewn synthesis cyfnod hylif, a gellir eu trosi'n hydrasidau peptid, rhagflaenwyr asidau peptid adweithiol. Cyplu azide yw'r dull cyplu darn mwyaf poblogaidd o hyd mewn synthesis peptid cyfnod hylif.

Mae 3-methylpent-3-yl ester (OMpe) yn grŵp amddiffyn carboxyl asid-labile a ddefnyddir yn aml i amddiffyn y grŵp carboxyl o asid aspartig (Asp) mewn synthesis peptid cyfnod solet sy'n seiliedig ar Fmoc (Fmoc-SPPS). ).Datblygwyd y analog ester tert-biwtyl mwy heriol hwn yn benodol i leihau ffurfiant asparagimide sylfaen-catalyzed.

Mae esters ortho-nitrophenyl o asidau amino Boc- neu Z yn ddeilliadau wedi'u gweithredu ymlaen llaw a ddefnyddir mewn synthesis hydoddiant peptid.

Cynhyrchir Ornithine (Orn) o arginin yn ystod y cylch wrea a gellir ei arsylwi hefyd mewn peptidau fel cynnyrch diraddio arginin. Mae ffurfio corn trwy asioliad y moiety guanidine o arginine yn adwaith ochr cyffredin mewn synthesis peptidau.

Mae ester hydroxysuccinimide (OSu, wedi'i dalfyrru fel GIG) yn ddeilliad asid amino rhagweithredol a ddefnyddir yn gyffredin mewn synthesis peptid, yn enwedig addasu peptid. Mae esters OSu yn ddiogel, heb fod yn sterig, yn gydnaws â systemau dyfrllyd ac yn hawdd eu trin.

Tert-butyl ester, grŵp amddiffyn carboxyl asid-labile ar gyfer asidau amino mewn synthesis peptid.

4-asid aminobenzoic (asid para-aminobenzoic), Gellir ei ddefnyddio ar gyfer synthesis cysylltwyr cyfun gwrthgorff-cyffuriau. Er enghraifft, mae Mal-PEG2-Val-Cit-PABA) yn gysylltydd cyffuriau gwrthgorff cyfun (ADC) holltadwy.

Mae PABC (para-aminobenzyl carbamate) yn gyfansoddyn cemegol a ddefnyddir wrth synthesis cyfuniadau gwrthgyrff-cyffuriau (ADCs) fel cysylltydd. Mae'n hwyluso atodi cyffuriau i wrthgyrff mewn modd rheoledig, gan alluogi cyflenwi cyffuriau wedi'u targedu mewn therapïau canser a chymwysiadau biofeddygol eraill. Er enghraifft, mae Mc-Val-Cit-PABC-PNP yn gysylltydd cleavable cathepsin a ddefnyddir mewn cyfuniadau gwrthgorff-cyffuriau (ADCs).

Mae polypeptid sy'n ysgogi adenylate pituitary cyclase (PACAP) yn niwropeptid gwarchodedig iawn a fynegir yn amlwg ledled yr ymennydd mamalaidd. Mae'n cyflawni ei effeithiau biolegol trwy wella lefelau CRhA cylchol mewngellol trwy ryngweithio derbynyddion.

Palmitoyl, grŵp acyl anbegynol a gyflwynwyd yn y derfynfa neu'r ochr N. Mae palmitoylation hefyd wedi'i arsylwi fel addasiad ôl-gyfieithu o broteinau.

Mae resin methyl phenylacetamide yn resin a ddyluniwyd yn benodol ar gyfer synthesis peptid cyfnod solet Boc (Boc-SPPS). Gellir rhyddhau peptidau wedi'u syntheseiddio ar y resin hwn gan ddefnyddio holltiad HF.

Yn Antibody-Drug Conjugates (ADCs), mae'r cysylltydd yn cysylltu'r gwrthgorff â'r llwyth tâl sytotocsig. Mae'r dewis o lwyth tâl yn hollbwysig gan ei fod yn pennu effeithiolrwydd a phenodoldeb ADCs wrth ddarparu therapi i feinweoedd targed trwy fecanweithiau rhyddhau penodol.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) yw'r grŵp amddiffyn guanidino a ffefrir a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet sy'n seiliedig ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Mae'n arddangos asid-lability ychydig yn uwch o gymharu â Pmc.

Mae penicillamine yn analog o L-cystein a nodweddir gan amnewid grŵp methyl (-CH3) ag asid carbocsilig (-COOH).

Hunan-gynulliad peptidau yw pan fydd peptidau'n trefnu eu hunain yn strwythurau trefnedig yn naturiol heb ymyrraeth allanol. mae'r broses hon yn cael ei gyrru gan ryngweithiadau nad ydynt yn cofalent megis bondio hydrogen, rhyngweithiadau hydroffobig, grymoedd electrostatig, a phentyrru π-π. Gall hunan-gynulliad peptid arwain at ffurfio nanostrwythurau amrywiol gan gynnwys ffibrau, sfferau, cynfasau a geliau, sydd â chymwysiadau mewn gwyddor deunyddiau, biotechnoleg a meddygaeth.

Mae Phenylacetyl (Phenylac neu Phac) yn grŵp acyl sydd fel arfer yn gysylltiedig â therminws N peptidau, a nodweddir gan bolaredd is o'i gymharu ag asetyl (Ac). Mae'n gyfystyr ag addasiad parhaol o peptidau.

Mae ffenylglycine (Phg) yn ddeilliad asid amino lle mae grŵp ffenyl yn cymryd lle'r atom hydrogen yn y moleciwl glycin

Peptid Histidine Isoleucine (PHI), peptid mochyn sy'n gysylltiedig â VIP a secretin.

Methionin histidine peptid (PHM), peptid dynol sy'n gysylltiedig â VIP.

Diffinnir y pwynt isoelectric (pI) fel lefel y pH lle mae gan y protein / peptid wefr net o sero (Smoluch et al., 2016).

Mae 2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonyl (Pmc) yn grŵp amddiffyn guanidinyl a ddefnyddir yn gyffredin mewn synthesis peptid cyfnod solet sy'n seiliedig ar Fmoc (Fmoc-SPPS). Mae'n nodedig am fod ychydig yn llai o asid-labile o'i gymharu â Pbf.

Mae p-Nitroaniline, cromoffor, fel arfer yn cael ei gyfuno â therminws C swbstradau carboxypeptidase. Mae amsugniad y p-nitroaniline rhydd yn cael ei fesur yn gyffredin ar donfeddi tua 405 neu 410 nm.

Mae L-Propargylglycine (Pra) yn cael ei gynhyrchu gan ficro-organebau. Mae'r asid amino hwn, a nodweddir gan ei strwythur bond triphlyg, yn cael ei barchu'n fawr fel uned sylfaenol ar gyfer syntheseiddio peptidau sy'n gallu cymryd rhan mewn adweithiau "cemeg clicio", gan ennill sylw sylweddol yn y maes.

Mae hormon parathyroid (PTH) yn hormon peptid a ryddhawyd gan y chwarennau parathyroid, sy'n hanfodol ar gyfer cynnal homeostasis calsiwm a ffosfforws yn yr hylif allgellog.

Mae addasiadau ôl-gyfieithu (PTMs) o broteinau yn ychwanegu grwpiau gweithredol neu broteinau, yn torri is-unedau rheoleiddio, neu'n torri i lawr proteinau cyfan. Mae'r newidiadau hyn, fel ffosfforyleiddiad, glycosylation, methylation, asetylation, lipidation, ubiquitination, nitrosylation, a proteolysis, yn effeithio ar sut mae celloedd yn gweithio fel arfer ac yn ystod afiechyd. Mae deall PTMs yn hanfodol ar gyfer ymchwil sylfaenol a dod o hyd i driniaethau newydd.

asid pyroglutamig, a elwir hefyd gan fyrfoddau fel Pgl, Glp, pGlu, neu

Mae ffenylazobenzylmethoxycarbonyl yn grŵp gwarchod N cromofforig a ddefnyddir mewn synthesis peptid, y gellir ei hollti gan hydrogeniad catalytig neu asid cryf. Mae'n arddangos tonfeddi amsugno uchaf ar 229 nm, 320 nm, a 441 nm.

Mae pâr quencher yn cynnwys moleciwl fflwroleuol (fflworoffor) a moleciwl quencher a ddefnyddir mewn ymchwil a phrofion sy'n seiliedig ar fflworoleuedd. Mae'r quencher yn amsugno'r golau a allyrrir gan y fflworoffor, gan leihau ei fflworoleuedd. Pan fydd y fflworoffor a'r quencher yn cael eu gwahanu, megis trwy adwaith biocemegol, mae'r signal fflworoleuedd yn cynyddu. Mae hyn yn galluogi ymchwilwyr i fesur newidiadau a rhyngweithiadau amser real. Defnyddir y dechneg hon yn gyffredin mewn cymwysiadau fel PCR amser real, stilwyr moleciwlaidd, a phrofion FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

Mae fflworin-18 yn radioligand a ddefnyddir yn gyffredin mewn delweddu PET i asesu metaboledd glwcos mewn meinweoedd ac fe'i defnyddir yn gyffredin mewn diagnosis canser a delweddu'r ymennydd.

Mae llyfrgell peptid ar hap yn gasgliad o lawer o ddilyniannau peptid byr a gynhyrchir ar hap. Mae gan bob peptid yn y llyfrgell nifer benodol o asidau amino gyda dilyniannau a bennir ar hap, gan greu ystod amrywiol o moleciwlau peptid. Mae ymchwilwyr yn defnyddio'r llyfrgelloedd hyn i sgrinio am peptidau ag eiddo penodol, gweithgareddau biolegol, neu ryngweithio â moleciwlau targed. Maent yn arbennig o ddefnyddiol mewn darganfod cyffuriau, imiwnoleg, ac astudiaethau o ryngweithiadau protein-protein, gan helpu i nodi therapiwteg newydd a deall prosesau biolegol cymhleth.

Mae gweddillion yn asid amino unigol o fewn peptid neu brotein. Wrth i asidau amino ymuno â'i gilydd trwy fondiau peptid i ffurfio'r cadwyni hyn, gelwir pob uned asid amino yn weddillion. Defnyddir y term hwn oherwydd yn ystod ffurfio'r bond peptid, mae pob asid amino yn colli moleciwl dŵr (H2O), gan adael yr hyn y cyfeirir ato fel gweddillion ar ôl.

Mae resin yn bolymer anhydawdd a ddefnyddir mewn synthesis peptid cyfnod solet (SPPS) fel cefnogaeth gadarn ar gyfer ychwanegu asidau amino yn barhaus. Mae gleiniau resin yn darparu arwyneb sefydlog ac anadweithiol y mae'r asidau amino cychwynnol wedi'u cysylltu'n cofalent ag ef, gan ganiatáu i'r gadwyn peptid gael ei adeiladu gweddillion wrth weddillion.

Lliw pinc i goch llachar yw Rhodamine B gyda thonfedd cyffro fel arfer tua 540-570 nm ac ystod golau wedi'i allyrru o 560-580 nm. Fe'i cyfunir fel arfer â'r dilyniant peptid trwy grŵp amino N-terminal y peptid

Cromatograff hylif perfformiad uchel cyfnod gwrthdroi.

Datblygir cyffuriau Perthynas Strwythur-Gweithgaredd (SAR) trwy astudio'r berthynas rhwng strwythur cemegol cyffur a'i weithgaredd biolegol.

Sarcosin, yr asid amino N-alkylated symlaf.

Gellir defnyddio dimethylarginine cymesurol (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (cymesur) yn uniongyrchol ar gyfer synthesis peptidau sy'n cynnwys dimethylarginine cymesur.

Mae synthesis peptid cyfnod solet (SPPS) yn ddull ar gyfer synthesis cemegol peptidau, lle mae peptidau'n cael eu cydosod fesul cam ar gynhalydd solet neu resin trwy ychwanegu asidau amino gwarchodedig yn olynol. Mae SPPS yn cwmpasu dwy strategaeth: Fmoc-SPPS a Boc-SPPS, sy'n wahanol yn y dewis o grwpiau gwarchod N-amino grŵp (Fmoc neu Boc) a grwpiau gwarchod cadwyn ochr. Mae'r math o grŵp amddiffyn N-amino a ddewiswyd yn pennu strategaeth amddiffyn y gadwyn ochr a'r amodau ar gyfer holltiad terfynol y peptid o'r resin.

Mae Statin, a dalfyrrir fel Sta, yn asid amino di-brotein a ddefnyddir yn aml wrth ddylunio mimetigau peptid, yn enwedig wrth synthesis atalyddion proteas.

Mae Tert-Butylthio (StBu) yn grŵp amddiffyn S sy'n cael ei hollti gan ostyngiad ffosffin ac sy'n gydnaws â Boc-SPPS.

Addasiad N-terminal pegynol yw Succinyl sy'n cyfateb i aspartate wedi'i ddadamineiddio ac sydd fel arfer wedi'i ymgorffori mewn swbstradau carboxypeptidase.

Mae TAMRA, sydd hefyd yn cael ei dalfyrru fel TMR, yn fflworoffor y gellir ei gysylltu â grŵp amino. Fe'i defnyddir yn aml mewn cyfuniad â FAM ar gyfer swbstradau FRET. Mae gan TAMRA donfedd cyffro o 485 nm a thonfedd allyriadau o 535 nm.

Mae Tert-butyl yn grŵp amddiffyn asid-labile a ddefnyddir yn gyffredin ar gyfer alcoholau a ffenolau, y gellir ei hollti gan ddefnyddio asid trifluoroacetig (TFA).

Mae ffosffad triethylammonium yn glustog a ddefnyddir mewn cyfnodau symudol HPLC gwrthdroi.

Defnyddiwyd asid trifluoroacetig (TFA) ar gyfer holltiad peptid o resin yn Fmoc-SPPS ac i gael gwared ar grwpiau amddiffyn sy'n deillio o tBu.

Mae asid trifluoromethanesulfonig (TFMSA) yn asid cryfach na TFA. Gellir defnyddio TFMSA fel dewis mwy diogel yn lle HF hynod wenwynig ar gyfer cam holltiad olaf strategaeth Boc-SPPS.

Mae L-tert-leucine (Tle) yn asid amino anpolar gyda chadwyni ochr heriol sy'n ansefydlogi -helices.

2,4,6-Mae Trimethoxybenzyl yn grŵp amddiffyn asid-labile Asn a Gln amide a ddefnyddir yn Fmoc-SPPS.

Defnyddir Tosyl fel grŵp amddiffyn ar gyfer guanidine ac imidazole yn Boc-SPPS, a gellir ei dynnu gan Na/NH3

Mae Trityl (Trt) yn grŵp amddiffyn asid-labile a gyflogir ar gyfer Asn, Cys, Gln, a'i weddillion yn Fmoc-SPPS. Gellir ei dynnu'n ddetholus gan ddefnyddio asid trifluoroacetig (TFA).

Mae peptidau pur fel arfer yn bodoli mewn cyflwr powdr gwyn ar ôl rhewi-sychu.

Mae peptid coluddol fasoweithredol (VIP) yn 28-peptid asid amino sy'n perthyn i'r superfamily peptid glwcagon-ghrelin-secretin.

9-Mae Xanthydryl (Xan) yn grŵp amddiffyn amid asid-labile a ddefnyddir ar gyfer gweddillion Asn a Gln yn Boc-SPPS. Gellir tynnu Xan yn ddetholus gan ddefnyddio TFA.

Pan fydd y peptid wedi'i labelu â FAM fluorescein, mae'r powdr lyophilized fel arfer yn arddangos ymddangosiad melyn.

Defnyddir Z-benzyloxycarbonyl, wedi'i dalfyrru fel Z neu Cbz, fel grŵp amddiffyn amino mewn synthesis peptidau. Gellir ei dynnu gan ddefnyddio hydrogenolysis neu asidau cryf fel HF taclus neu HBr / asid asetig.