Dylanwad toddyddion ar hydoddedd peptidau
Mae hydoddedd peptidau yn cael ei ddylanwadu gan eu cyfansoddiad asid amino. Mae asidau amino hydroffobig fel leucine (Leu), isoleucine (Ile), a valine (Val) yn gwneud peptidau hydroffobig, tra bod asidau amino hydroffilig fel lysin (Lys), histidine (His), arginine (Arg) yn gwneud peptidau hydroffilig. Felly, mae gan wahanol beptidau hydoddedd gwahanol oherwydd eu gwahaniaethau cyfansoddiadol.
Effaith toddyddion ar sefydlogrwydd peptid
Deamidation adwaith
Yn yr adwaith deamidation, mae hydrolysis gweddillion asparagine (Asn) a glutamine (Gln) yn ffurfio asid aspartig (Asp) ac asid glutamig (Glu). Gall yr adweithiau hyn effeithio ar sefydlogrwydd peptidau.
Ocsidiad
Mae hydoddiannau peptid yn dueddol o ocsideiddio, a all fod oherwydd halogiad perocsid yn yr hydoddiant neu ocsidiad digymell y peptid ei hun. Mae ocsidiad nid yn unig yn effeithio ar strwythur peptidau, ond gall hefyd arwain at golli eu swyddogaeth.
Hydrolysis
Mae bondiau peptid mewn peptidau yn hawdd eu hydrolysu a'u torri, yn enwedig y rhai a ffurfiwyd gan Asp.
Gwall ffurfio bond disulfide
Gall cyfnewid rhwng bondiau disulfide neu rhwng bondiau disulfide a grwpiau thiol arwain at ffurfio bondiau disulfide anghywir, gan arwain at newidiadau mewn strwythur trydyddol a cholli gweithgaredd.
Adwaith racemig
Ac eithrio glycin (Gly), mae atomau alffa carbon yr holl weddillion asid amino yn giral ac yn dueddol o gael adweithiau rasio o dan gatalysis alcalïaidd. Yn eu plith, mae gweddillion asid aspartig (Asp) yn fwyaf agored i adweithiau rasio.
- dileu
- mae dileu yn cyfeirio at ddileu grwpiau swyddogaethol ar yr atom carbon mewn gweddillion asid amino. Mae'r adwaith hwn yn fwy tebygol o ddigwydd ar pH alcalïaidd, ac mae tymheredd ac ïonau metel hefyd yn cael effaith arno.
Hydoddi peptidau mewn toddyddion sy'n gyfeillgar i'r amgylchedd
Wrth hydoddi peptidau, gellir defnyddio swm bach o N-methylpyrrolidone (DMF) neu dimethyl sulfoxide (DMSO) i gynorthwyo i ddiddymu. Gall y ddau doddydd hyn hyrwyddo diddymu trwy amharu ar strwythur eilaidd peptidau. Fodd bynnag, dylid nodi y gall y toddyddion hyn ymyrryd â gweithgaredd biolegol peptidau a gwaith ymchwil dilynol, felly dylid bod yn ofalus wrth eu defnyddio.
Casgliad
I grynhoi, gall toddyddion sy'n gyfeillgar i'r amgylchedd fel DMF a DMSO helpu i ddiddymu peptidau trwy amharu ar eu strwythur eilaidd, ond gall eu defnydd gael effaith ar strwythur a gweithgaredd biolegol peptidau. Felly, wrth ddewis a defnyddio toddyddion sy'n gyfeillgar i'r amgylchedd, mae angen pwyso a mesur eu heffaith ar strwythur peptid a hydoddedd i sicrhau sefydlogrwydd a gweithgaredd biolegol peptidau.