Ansefydlogrwydd peptidau yw un o'r prif broblemau yn eu hymchwil ffurfio, ac mae yna lawer o resymau dros hyn. Ond nid oes llawer o brif resymau dros ansefydlogrwydd peptid penodol. Gall astudiaeth fanwl o effeithiau amodau allanol (fel pH, tymheredd, golau, crynodiad ocsigen, ac ati) ar sefydlogrwydd peptidau helpu i ddylunio ffurfiad rhesymegol. Er nad yw'r mecanwaith y mae ychwanegion yn sefydlogi peptidau wedi'i ddeall yn llawn eto, mae'r defnydd o ychwanegion yn dal i fod yn un o'r prif ffyrdd o wella sefydlogrwydd fformwleiddiadau peptid. Gall cymhwyso dulliau dadansoddol fel CD a DSC helpu i sgrinio'n gyflym ar gyfer ychwanegion addas.
Rhesymau dros ansefydlogrwydd peptid:
Adwaith dadamidation: Yn yr adwaith dad-aseyliad, mae gweddillion Asn/Gln yn cael eu hydroleiddio i ffurfio Asp/Glu. Mae'r adwaith deamidation anensymatig yn cael ei gynnal. Mae'r grwpiau amid yn strwythur Asn Gly yn cael eu hydrolysu'n haws, ac mae'r grwpiau amid sydd wedi'u lleoli ar wyneb y moleciwl hefyd yn cael eu hydrolysu'n haws na'r rhai y tu mewn i'r moleciwl.
Mae dau brif reswm pam mae hydoddiannau peptid yn dueddol o ocsideiddio: un yw halogiad perocsidau yn yr hydoddiant, a'r llall yw ocsidiad peptidau yn ddigymell. Ymhlith yr holl weddillion asid amino, Met, Cys, His, Trp, Tyr, ac ati yw'r rhai mwyaf hawdd eu ocsideiddio. Mae pwysedd rhannol ocsigen, tymheredd, a hydoddiant byffer hefyd yn cael effaith ar ocsidiad.
Hydrolysis: Mae bondiau peptid mewn peptidau yn hawdd eu hydrolysu a'u torri. Mae bondiau peptid a ffurfiwyd gan Asp yn cael eu torri'n haws na bondiau peptid eraill, yn enwedig bondiau peptid Asp Pro ac Asp Gly.
Ffurfio bondiau disulfide anghywir: Gall cyfnewid rhwng bondiau desulfide neu rhwng bondiau desulfide a grwpiau thiol ffurfio bondiau deusylfid anghywir, gan arwain at newidiadau mewn strwythur trydyddol a cholli gweithgaredd.
Racemization: Ac eithrio Gly, mae'r atomau alffa carbon o'r holl weddillion asid amino yn giral ac yn hawdd cael adweithiau rasio o dan gatalysis alcalïaidd. Yn eu plith, mae gweddillion Asp yn fwyaf agored i adweithiau rasio.
- dileu: - dileu yn cyfeirio at ddileu grwpiau swyddogaethol ar y - atom carbon mewn gweddillion asid amino. Gall Cys, Ser, Thr, Phe, Tyr a gweddillion eraill gael eu diraddio trwy - dileu. - mae dileu yn dueddol o ddigwydd ar pH alcalïaidd, ac mae ïonau tymheredd a metel hefyd yn cael effaith arno.
Yn gyffredinol, mae dadnatureiddio, arsugniad, agregu, neu wlybaniaeth yn gysylltiedig â dinistrio strwythurau trydyddol ac eilaidd. Yn y cyflwr dadnatureiddio, mae peptidau yn aml yn fwy tueddol o gael adweithiau cemegol ac mae'n anodd adfer eu gweithgaredd. Yn y broses o ddadnatureiddio peptid, ffurfir canolradd yn gyntaf. Mae hydoddedd canolradd fel arfer yn isel, gan eu gwneud yn hawdd i'w hagregu a ffurfio agregau, sydd yn eu tro yn ffurfio gwaddodion gweladwy i'r llygad noeth.
Mae arsugniad arwyneb proteinau yn broblem cur pen arall a gafwyd yn ystod eu storio a'u defnyddio, megis riL-2 arsugniad ar wyneb y biblinell yn ystod darlifiad Qu, gan achosi colled gweithgaredd.