Mae rôl amddiffyn grwpiau yn hanfodol mewn synthesis peptid ac asid niwclëig, yn enwedig wrth synthesis moleciwlau cymhleth fel asidau niwclëig peptid (PNA). Mae PNA yn analog DNA gydag asgwrn cefn tebyg i peptid, y mae ei brif asgwrn cefn yn cynnwys N (2- aminoethyl) - basau glycin ac asid niwclëig wedi'u cysylltu gan grwpiau carbonyl methylene. Yn y broses synthesis o PNA, y defnydd o grwpiau amddiffynnol yw amddiffyn grwpiau swyddogaethol penodol, eu hatal rhag cael eu bwyta mewn adweithiau diangen, a sicrhau synthesis a phuro effeithlon o foleciwlau targed.
Dewis a Swyddogaeth Canolfannau Amddiffynnol
Diogelu asidau amino: Yn y synthesis o PNA, mae gan y grŵp guanidine o arginine niwcleoffiledd cryf ac alcalinedd, ac mae angen ei amddiffyn i atal ei symud o dan amodau asidig ac alcalïaidd. Mae grwpiau amddiffynnol cyffredin yn cynnwys tert butoxycarbonyl, nitro, toluenesulfonyl, trifluoroacetyl, benzyloxyformyl, ac ati.
Diogelu grwpiau carboxyl: Efallai y bydd angen amddiffyniad hefyd ar grwpiau carboxyl mewn cadwyni peptid i'w hatal rhag cymryd rhan mewn adweithiau diangen. Er enghraifft, yn y synthesis o ILE Glu ( - pip), mae'r grŵp amino o ILE yn cael ei warchod gan FMOC, tra bod y grŵp carboxyl o GLU yn cael ei warchod gan TBU.
Diogelu'r cromoffor: mae gan p-nitroaniline (y cromoffor yn PNA) niwcleoffiledd gwael oherwydd effaith tynnu electronau cryf grwpiau nitro, gan ei gwneud hi'n anodd cysylltu ag asidau amino trwy ddulliau anwedd amid cyffredinol. Yn y ddyfais bresennol, mae'r broblem o gysylltu p-nitroaniline yn cael ei datrys trwy gysylltu p-phenylenediamine yn gyntaf i asid amino ac yna ei ocsidio. Mae'r dull hwn yn fwy ecogyfeillgar, yn ddiogel, ac mae ganddo gynnyrch uwch.